Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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