Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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