Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAM1Q15629 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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