Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RYR3Q15413 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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