Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL19A1Q14993 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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