Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ODF1Q14990 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF1Q14990 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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