Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CKAP5Q14008 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CKAP5Q14008 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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