Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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