Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PEX6Q13608 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PEX6Q13608 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PEX6Q13608 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PEX6Q13608 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PEX6Q13608 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PEX6Q13608 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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PEX6Q13608 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PEX6Q13608 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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