Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
SF3B2Q13435 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B2Q13435 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms