Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGB3BPQ13352 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGB3BPQ13352 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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