Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIGQ13278 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIGQ13278 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIGQ13278 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIGQ13278 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIGQ13278 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIGQ13278 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIGQ13278 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIGQ13278 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIGQ13278 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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