Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RESTQ13127 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RESTQ13127 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RESTQ13127 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RESTQ13127 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RESTQ13127 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RESTQ13127 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RESTQ13127 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RESTQ13127 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RESTQ13127 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RESTQ13127 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RESTQ13127 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RESTQ13127 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RESTQ13127 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RESTQ13127 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RESTQ13127 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RESTQ13127 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RESTQ13127 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RESTQ13127 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RESTQ13127 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RESTQ13127 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RESTQ13127 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RESTQ13127 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RESTQ13127 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RESTQ13127 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RESTQ13127 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RESTQ13127 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RESTQ13127 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RESTQ13127 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RESTQ13127 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RESTQ13127 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RESTQ13127 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RESTQ13127 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RESTQ13127 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RESTQ13127 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RESTQ13127 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RESTQ13127 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RESTQ13127 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RESTQ13127 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms