Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TRAF3Q13114 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TRAF3Q13114 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TRAF3Q13114 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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