Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRDNQ13061 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms