Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GRIK2Q13002 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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