Protein–RNA interactions for Protein: Q12428

PDH1, Probable 2-methylcitrate dehydratase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDH1Q12428 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.8□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.8□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 GPI15YNL038W 690 nt2.8□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 YOR169CYOR169C 465 nt2.8□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 RPL33AYPL143W 324 nt2.8□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 RSA1YPL193W 1146 nt2.8□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 SSF1YHR066W 1362 nt2.79□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 BNA7YDR428C 786 nt2.79□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.79□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 YGL015CYGL015C 393 nt2.79□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 YGR242WYGR242W 309 nt2.79□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 RPB5YBR154C 648 nt2.79□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 GEA1YJR031C 4227 nt2.79□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 GDS1YOR355W 1569 nt2.78□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 YEL1YBL060W 2064 nt2.78□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 APC2YLR127C 2562 nt2.78□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 BI4Q0120 1917 nt2.78□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 YCR090CYCR090C 549 nt2.78□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 SAS2YMR127C 1017 nt2.78□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 PRM3YPL192C 402 nt2.78□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 SSP1YHR184W 1716 nt2.78□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 GCV2YMR189W 3105 nt2.78□□□□□ -1.96
PDH1Q12428 RAX2YLR084C 3663 nt2.78□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YLR001CYLR001C 2589 nt2.77□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 AHC2YCR082W 387 nt2.77□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YDL009CYDL009C 324 nt2.77□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 DYN2YDR424C 279 nt2.77□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 BI2Q0110 1272 nt2.77□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 CTK3YML112W 891 nt2.77□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.77□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 RRT16YNL105W 429 nt2.77□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 TOM22YNL131W 459 nt2.77□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 HEM4YOR278W 828 nt2.77□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 VID24YBR105C 1089 nt2.77□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 CEP3YMR168C 1827 nt2.77□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 NEW1YPL226W 3591 nt2.76□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 SGS1YMR190C 4344 nt2.76□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.76□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YKL063CYKL063C 504 nt2.76□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 IGO1YNL157W 507 nt2.76□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.76□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 TOM1YDR457W 9807 nt2.76□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 PMR1YGL167C 2853 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YMR31YFR049W 372 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YAP3YHL009C 993 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YAL037WYAL037W 804 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 MRP49YKL167C 414 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 BUD21YOR078W 645 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YPR203WYPR203W 309 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 snR41snR41 95 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 FKS3YMR306W 5358 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YDR186CYDR186C 2634 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 GCD6YDR211W 2139 nt2.75□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 SLH1YGR271W 5904 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 SPB1YCL054W 2526 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 NOP19YGR251W 591 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 RPI1YIL119C 1224 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YLR297WYLR297W 390 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YNR021WYNR021W 1215 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 BPT1YLL015W 4680 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 SUL1YBR294W 2580 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 ALY1YKR021W 2748 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YPL150WYPL150W 2706 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 SPO23YBR250W 1572 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 SSF2YDR312W 1362 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 GDI1YER136W 1356 nt2.74□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 FUS1YCL027W 1539 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YDR157WYDR157W 402 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 AGA2YGL032C 264 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 ECL1YGR146C 636 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 DFG10YIL049W 762 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 HRI1YLR301W 735 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 COQ10YOL008W 624 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 FYV12YOR183W 390 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YPR014CYPR014C 330 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YBR209WYBR209W 318 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 JSN1YJR091C 3276 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 GCD10YNL062C 1437 nt2.73□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YDR114CYDR114C 303 nt2.72□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 RPS26BYER131W 360 nt2.72□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YGL042CYGL042C 306 nt2.72□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 OTU2YHL013C 924 nt2.72□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt2.72□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.72□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 PHD1YKL043W 1101 nt2.72□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YHC1YLR298C 696 nt2.72□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 MRPL33YMR286W 261 nt2.72□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YOL134CYOL134C 390 nt2.72□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 OST2YOR103C 393 nt2.72□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 YPR012WYPR012W 255 nt2.72□□□□□ -1.97
PDH1Q12428 IKI3YLR384C 4050 nt2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.6 ms