Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YPL216WYPL216W 3309 nt3.46□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 HOP1YIL072W 1818 nt3.46□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 FAR1YJL157C 2493 nt3.46□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 MSL5YLR116W 1431 nt3.45□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 ECM21YBL101C 3354 nt3.45□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 TCD1YHR003C 1290 nt3.45□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YKL066WYKL066W 444 nt3.45□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YPL197CYPL197C 414 nt3.45□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 VID24YBR105C 1089 nt3.45□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 DUF1YOL087C 3351 nt3.45□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 PCK1YKR097W 1650 nt3.45□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 NDT80YHR124W 1884 nt3.45□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 CWH41YGL027C 2502 nt3.44□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 TCB2YNL087W 3537 nt3.44□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YCR090CYCR090C 549 nt3.44□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 ARV1YLR242C 966 nt3.44□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YBR032WYBR032W 303 nt3.44□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 FRE2YKL220C 2136 nt3.44□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 VAC8YEL013W 1737 nt3.44□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 CHS2YBR038W 2892 nt3.44□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YME2YMR302C 2553 nt3.43□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.43□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 MRH1YDR033W 963 nt3.43□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YJL169WYJL169W 369 nt3.43□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YJR079WYJR079W 330 nt3.43□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 RPL40BYKR094C 387 nt3.43□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 TEN1YLR010C 483 nt3.43□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 BSC3YLR465C 309 nt3.43□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 EAP1YKL204W 1899 nt3.43□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 EPL1YFL024C 2499 nt3.43□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 BUD4YJR092W 4344 nt3.43□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 PDS5YMR076C 3834 nt3.42□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YRR1YOR162C 2433 nt3.42□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YGR242WYGR242W 309 nt3.42□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 NBL1YHR199C-A 222 nt3.42□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 RPL8BYLL045C 771 nt3.42□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 COA4YLR218C 453 nt3.42□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 FMP23YBR047W 528 nt3.42□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 RRD2YPL152W 1077 nt3.42□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 MSH4YFL003C 2637 nt3.42□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 RSN1YMR266W 2862 nt3.42□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 FLO1YAR050W 4614 nt3.42□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 NMA111YNL123W 2994 nt3.42□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 TOM70YNL121C 1854 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 TAF2YCR042C 4224 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 SIN3YOL004W 4611 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 RTR2YDR066C 591 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YER181CYER181C 324 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 VEL1YGL258W 621 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YHL005CYHL005C 393 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 OTU2YHL013C 924 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YLR434CYLR434C 384 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 SWM2YNR004W 441 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 SFM1YOR021C 642 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 MRPL40YPL173W 894 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 SPO14YKR031C 5052 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 SEN54YPL083C 1404 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YJR098CYJR098C 1971 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YCK2YNL154C 1641 nt3.41□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 KHA1YJL094C 2622 nt3.4□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 ATP22YDR350C 2055 nt3.4□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 DYN2YDR424C 279 nt3.4□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 RPL27BYDR471W 411 nt3.4□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 MRPL38YKL170W 417 nt3.4□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 CGI121YML036W 546 nt3.4□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt3.4□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 RPS12YOR369C 432 nt3.4□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 GPI17YDR434W 1605 nt3.4□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 DIA2YOR080W 2199 nt3.39□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 URB2YJR041C 3525 nt3.39□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 EXO84YBR102C 2262 nt3.39□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YPS5YGL259W 498 nt3.39□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 LSM8YJR022W 330 nt3.39□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 ADI1YMR009W 540 nt3.39□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 RPL16BYNL069C 597 nt3.39□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 RRT16YNL105W 429 nt3.39□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YOL150CYOL150C 312 nt3.39□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 PUF6YDR496C 1971 nt3.39□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 TLC1TLC1 1301 nt3.39□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 CSR2YPR030W 3366 nt3.38□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 PSK1YAL017W 4071 nt3.38□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt3.38□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.38□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt3.38□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.38□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YLR302CYLR302C 363 nt3.38□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 COX14YML129C 213 nt3.38□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 UBC7YMR022W 498 nt3.38□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YDR338CYDR338C 2088 nt3.38□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 KAP104YBR017C 2757 nt3.38□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 RIX1YHR197W 2292 nt3.37□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YIL169CYIL169C 2988 nt3.37□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 CBP2YHL038C 1893 nt3.37□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YER137W-AYER137W-A 306 nt3.37□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 RNR4YGR180C 1038 nt3.37□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 SRL3YKR091W 741 nt3.37□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 YPL142CYPL142C 318 nt3.37□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 FAA2YER015W 2235 nt3.37□□□□□ -1.87
CLF1Q12309 POL2YNL262W 6669 nt3.37□□□□□ -1.87
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