Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC173Q0VFZ6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms