Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBBP4Q09028 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms