Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 BCK1YJL095W 4437 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 GDI1YER136W 1356 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 NDT80YHR124W 1884 nt2.96□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 EBS1YDR206W 2655 nt2.96□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 POL4YCR014C 1749 nt2.96□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 HRD1YOL013C 1656 nt2.96□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 snR70snR70 164 nt2.96□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.96□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 CWC24YLR323C 780 nt2.96□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 DYN3YMR299C 939 nt2.96□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YOR199WYOR199W 330 nt2.96□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YPR197CYPR197C 564 nt2.96□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 snR43snR43 209 nt2.96□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 PSK1YAL017W 4071 nt2.96□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 SSF1YHR066W 1362 nt2.96□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 TOM70YNL121C 1854 nt2.96□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 HAA1YPR008W 2085 nt2.96□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 CDC55YGL190C 1581 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YAT2YER024W 2772 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 DBF20YPR111W 1695 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 NFT1YKR103W 3657 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YDL009CYDL009C 324 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 HTA1YDR225W 399 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 RPL14BYHL001W 417 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YIL174WYIL174W 228 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 RSN1YMR266W 2862 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 SSF2YDR312W 1362 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 RIM13YMR154C 2184 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 VAC14YLR386W 2643 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 KAR9YPL269W 1935 nt2.95□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 CAF120YNL278W 3183 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 IRC3YDR332W 2070 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 SEC26YDR238C 2922 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 PDC2YDR081C 2778 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 FMN1YDR236C 657 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 HIT1YJR055W 495 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 PBA1YLR199C 831 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YLR230WYLR230W 306 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 PKR1YMR123W 369 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 HHF2YNL030W 312 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 NOP15YNL110C 663 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 HHF1YBR009C 312 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YOR277CYOR277C 309 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 PIS1YPR113W 663 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YSY6YBR162W-A 198 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YNL193WYNL193W 1677 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 PTP3YER075C 2787 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 JSN1YJR091C 3276 nt2.94□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 SPE1YKL184W 1401 nt2.93□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 BI4Q0120 1917 nt2.93□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.93□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 RPS1AYLR441C 768 nt2.93□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 CDC33YOL139C 642 nt2.93□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 NEW1YPL226W 3591 nt2.93□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 VPS3YDR495C 3036 nt2.93□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 MUB1YMR100W 1863 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 PDR3YBL005W 2931 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 GPI19YDR437W 423 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 SPT2YER161C 1002 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 SMX2YFL017W-A 234 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 DFG10YIL049W 762 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YAL037WYAL037W 804 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YKL066WYKL066W 444 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 RPL40BYKR094C 387 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YLR269CYLR269C 351 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YOL134CYOL134C 390 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 LTP1YPR073C 486 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 DYN1YKR054C 12279 nt2.92□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 NAB6YML117W 3405 nt2.91□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 ESL2YKR096W 3588 nt2.91□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 RTR2YDR066C 591 nt2.91□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YGR053CYGR053C 852 nt2.91□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 PEP8YJL053W 1140 nt2.91□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 COX8YLR395C 237 nt2.91□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YBR032WYBR032W 303 nt2.91□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 YPL225WYPL225W 441 nt2.91□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 MSH2YOL090W 2895 nt2.91□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 GIN4YDR507C 3429 nt2.91□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 PDR1YGL013C 3207 nt2.91□□□□□ -1.94
DSE3Q08729 RPO41YFL036W 4056 nt2.9□□□□□ -1.95
DSE3Q08729 YIL054WYIL054W 318 nt2.9□□□□□ -1.95
DSE3Q08729 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.9□□□□□ -1.95
DSE3Q08729 SWM2YNR004W 441 nt2.9□□□□□ -1.95
DSE3Q08729 YOL114CYOL114C 609 nt2.9□□□□□ -1.95
DSE3Q08729 YPL197CYPL197C 414 nt2.9□□□□□ -1.95
DSE3Q08729 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.9□□□□□ -1.95
DSE3Q08729 YPR203WYPR203W 309 nt2.9□□□□□ -1.95
DSE3Q08729 RTT10YPL183C 3042 nt2.9□□□□□ -1.95
DSE3Q08729 MAL33YBR297W 1407 nt2.9□□□□□ -1.95
DSE3Q08729 YRR1YOR162C 2433 nt2.9□□□□□ -1.95
DSE3Q08729 EAP1YKL204W 1899 nt2.9□□□□□ -1.95
DSE3Q08729 PEX5YDR244W 1839 nt2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.8 ms