Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP3CAQ08209 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms