Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF4Q08170 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms