Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCL9Q07325 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCL9Q07325 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms