Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms