Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TNP2Q05952 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TNP2Q05952 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms