Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 ATP17YDR377W 306 nt3.69□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 RPL29YFR032C-A 180 nt3.69□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YGR025WYGR025W 303 nt3.69□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.69□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 MCM22YJR135C 720 nt3.69□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 CPA2YJR109C 3357 nt3.68□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 ATP22YDR350C 2055 nt3.68□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 snR8snR8 190 nt3.68□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 FRQ1YDR373W 573 nt3.68□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YER097WYER097W 330 nt3.68□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 TVP18YMR071C 504 nt3.68□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YOR146WYOR146W 306 nt3.68□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 MUS81YDR386W 1899 nt3.67□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 BAR1YIL015W 1764 nt3.67□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 SLP1YOR154W 1764 nt3.67□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 LSM2YBL026W 288 nt3.67□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.67□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 IMP4YNL075W 873 nt3.67□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 SLM6YBR266C 453 nt3.67□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 CHS2YBR038W 2892 nt3.66□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YER076W-AYER076W-A 348 nt3.66□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 FMP32YFL046W 624 nt3.66□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 RAD6YGL058W 519 nt3.66□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 RPL37AYLR185W 267 nt3.66□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 GCD10YNL062C 1437 nt3.66□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 FLO10YKR102W 3510 nt3.66□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YGR237CYGR237C 2358 nt3.66□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.66□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 USE1YGL098W 738 nt3.65□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.65□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YIL012WYIL012W 342 nt3.65□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YIR040CYIR040C 333 nt3.65□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 BIL1YOR304C-A 231 nt3.65□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 ATP3YBR039W 936 nt3.65□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 NOP4YPL043W 2058 nt3.65□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YKL100CYKL100C 1764 nt3.65□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 URB2YJR041C 3525 nt3.65□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 MYO3YKL129C 3819 nt3.64□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 NOP19YGR251W 591 nt3.64□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YAR029WYAR029W 225 nt3.64□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YPR053CYPR053C 456 nt3.64□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 KHA1YJL094C 2622 nt3.64□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YSW1YBR148W 1830 nt3.63□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 LCB5YLR260W 2064 nt3.63□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 TIF35YDR429C 825 nt3.63□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 HOP2YGL033W 657 nt3.63□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 GEP4YHR100C 558 nt3.63□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 SRL3YKR091W 741 nt3.63□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 RPB11YOL005C 363 nt3.63□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 ARG2YJL071W 1725 nt3.63□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 MDM1YML104C 3384 nt3.63□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 ATP25YMR098C 1839 nt3.63□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 LRG1YDL240W 3054 nt3.62□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 HFM1YGL251C 3564 nt3.62□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 PHM6YDR281C 315 nt3.62□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 RPS21BYJL136C 264 nt3.62□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.62□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 URA10YMR271C 684 nt3.62□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 RPS7BYNL096C 573 nt3.62□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YPL276WYPL276W 438 nt3.62□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 RSF2YJR127C 4143 nt3.62□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 RRP5YMR229C 5190 nt3.62□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 NMD2YHR077C 3270 nt3.62□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 FAA2YER015W 2235 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 RPL1BYGL135W 654 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 PEX4YGR133W 552 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YJR023CYJR023C 402 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 PET191YJR034W 327 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YKL111CYKL111C 336 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 RPL19BYBL027W 570 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 RPL23AYBL087C 414 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 RPL1AYPL220W 654 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 ROX1YPR065W 1107 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 CHO2YGR157W 2610 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 CWC22YGR278W 1734 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 MSB2YGR014W 3921 nt3.61□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 CIN1YOR349W 3045 nt3.6□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 GSC2YGR032W 5688 nt3.6□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 FLO5YHR211W 3228 nt3.6□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 TMA108YIL137C 2841 nt3.6□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 ERB1YMR049C 2424 nt3.6□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 IRC4YDR540C 540 nt3.6□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.6□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 RPL39YJL189W 156 nt3.6□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 AIM32YML050W 936 nt3.6□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YBL108WYBL108W 306 nt3.6□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 ARK1YNL020C 1917 nt3.6□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 GCN1YGL195W 8019 nt3.59□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 DPB11YJL090C 2295 nt3.59□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 MDM32YOR147W 1869 nt3.59□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt3.59□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 HEM4YOR278W 828 nt3.59□□□□□ -1.83
HRQ1Q05549 NDT80YHR124W 1884 nt3.58□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 SPC72YAL047C 1869 nt3.58□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 AKR1YDR264C 2295 nt3.58□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 YDR102CYDR102C 333 nt3.58□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt3.58□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 YFL032WYFL032W 321 nt3.58□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 YGR107WYGR107W 450 nt3.58□□□□□ -1.84
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