Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCZQ05513 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms