Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARDQ03181 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARDQ03181 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms