Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TNFRSF17Q02223 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms