Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms