Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLCB3Q01970 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms