Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC42EP1Q00587 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms