Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTRA4P83105 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTRA4P83105 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms