Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN10P78369 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms