Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPS29P62273 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS29P62273 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS29P62273 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS29P62273 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS29P62273 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS29P62273 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS29P62273 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS29P62273 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS29P62273 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPS29P62273 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPS29P62273 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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