Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTXN1P60606 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms