Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB1P60022 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms