Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP4BP1P59074 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4BP1P59074 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms