Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP4P57796 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP4P57796 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP4P57796 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP4P57796 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP4P57796 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP4P57796 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP4P57796 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP4P57796 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP4P57796 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP4P57796 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP4P57796 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP4P57796 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP4P57796 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP4P57796 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP4P57796 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP4P57796 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP4P57796 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP4P57796 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP4P57796 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP4P57796 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP4P57796 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP4P57796 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP4P57796 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP4P57796 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP4P57796 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP4P57796 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP4P57796 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP4P57796 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP4P57796 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP4P57796 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP4P57796 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP4P57796 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP4P57796 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP4P57796 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP4P57796 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP4P57796 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP4P57796 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP4P57796 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP4P57796 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP4P57796 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP4P57796 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABP4P57796 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CABP4P57796 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CABP4P57796 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CABP4P57796 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms