Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BACE1P56817 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BACE1P56817 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BACE1P56817 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BACE1P56817 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BACE1P56817 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BACE1P56817 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BACE1P56817 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BACE1P56817 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BACE1P56817 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BACE1P56817 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BACE1P56817 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BACE1P56817 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BACE1P56817 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BACE1P56817 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BACE1P56817 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BACE1P56817 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BACE1P56817 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BACE1P56817 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BACE1P56817 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BACE1P56817 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BACE1P56817 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BACE1P56817 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms