Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YARSP54577 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YARSP54577 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YARSP54577 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YARSP54577 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YARSP54577 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YARSP54577 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YARSP54577 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YARSP54577 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YARSP54577 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YARSP54577 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YARSP54577 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms