Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCLCP48506 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCLCP48506 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCLCP48506 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCLCP48506 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCLCP48506 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCLCP48506 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCLCP48506 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCLCP48506 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCLCP48506 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCLCP48506 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCLCP48506 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCLCP48506 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCLCP48506 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCLCP48506 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCLCP48506 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCLCP48506 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCLCP48506 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCLCP48506 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCLCP48506 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCLCP48506 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCLCP48506 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCLCP48506 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCLCP48506 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCLCP48506 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCLCP48506 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCLCP48506 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCLCP48506 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCLCP48506 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCLCP48506 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCLCP48506 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCLCP48506 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GCLCP48506 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms