Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGIRP43119 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms