Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GRIK1P39086 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK1P39086 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms