Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGAEP38570 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGAEP38570 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ITGAEP38570 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms