Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTNNB1P35222 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNB1P35222 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms