Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GPC1P35052 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GPC1P35052 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GPC1P35052 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPC1P35052 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPC1P35052 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPC1P35052 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPC1P35052 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GPC1P35052 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms