Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD10P28358 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms