Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
DNMT1P26358 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DNMT1P26358 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms